虽然皇太极登基后金大汗后重新将其迎回，但是自始至终她都没有得到重新的册封，因而她不仅在后宫中没有任何的存在感，就连史书上都对其没有了记载，以至于她在哪一年去世都不为后人所知。哲哲是在明万历四十二年（1614年）嫁给了皇太极，成为府上的侧福晋，在乌拉那拉氏与皇太极离婚后，成为了皇太极的第三任正室大福晋。
可以说，皇太极的三段婚姻都是彻头彻尾的政治联姻。迎娶发妻钮祜禄氏是为了维系建州女真内部的稳定，迎娶乌拉那拉氏是为了巩固建州女真吞并乌拉部的战果，而迎娶哲哲，目的也是为了更好的建立和发展与蒙古科尔沁部落的关系。在此之前，努尔哈赤曾三次对科尔沁部，皆大败而归，于是努尔哈赤调整了对科尔沁部落的态度，加上此时漠南蒙古的“共主”林丹汗妄图吞并其他诸部完成统一，这也使得当时的建州女真与蒙古科尔沁部结成同盟，共同应对林丹汗。
所以不仅仅是皇太极，包括努尔哈赤在内的众多女真贵族都迎娶了来自科尔沁贵族家的女儿。就这样，哲哲正式来到了后金，同时也就此登上了大清王朝的历史舞台。后金天命十一年（1626年），年初努尔哈赤兵败宁远，随后又拖着病体亲征内喀尔喀五部，并在这一年的八月去世。而在努尔哈赤去世后，皇太极经由“八和硕贝勒”的推选，成为新一任的后金大汗，而哲哲作为皇太极的正室妻子，也就此成为了后金大福晋。
崇德元年（1636年），皇太极正式在盛京称帝，改国号为大清，哲哲毫无争议且实至名归的成为了皇太极的皇太极的中宫皇后。由于在此之前，不管是在建州女真时期还是在后金时期，最高统治者并不是称呼为“皇帝”，而是被尊为“大汗”，因而后宫之主也只是被称为“大妃”或者“大福晋”，所以清朝的“皇后”便是从皇太极改元称帝后才有的，所以哲哲也就此成为了清朝历史上第一位皇后。
“一姑两侄”，共同书写了清朝后宫的一段传奇往事。皇太极的“五宫后妃”，即中宫皇后哲哲，东宫关雎宫宸妃海兰珠，西宫麟趾宫贵妃娜木钟，次东宫衍庆宫淑妃巴特玛璪，次西宫永福宫庄妃布木布泰、即后来的孝庄太后，皆出自与蒙古部落之中。确切说来，这“五宫后妃”也仅仅出自于两个“家庭”。麟趾宫贵妃和衍庆宫淑妃，在此之前都是林丹汗的妻子，林丹汗败亡青海打草滩之后，她们带领着自己的部众和财产归顺了后金，而皇太极为了更好地控制林丹汗的察哈尔旧部，选择重新迎娶了这二人，并将其纳入到了“五宫后妃”之中。
而另外的三宫后妃则都出自于蒙古科尔沁部落，并且她们是亲姑侄的关系，哲哲是海兰珠和布木布泰亲姑姑，而海兰珠和孝庄则是亲姐妹。或者大家就有疑问了，既然是政治联姻，迎娶一个就好了，为什么要从这一家一口气迎娶三个女儿回来呢？其实答案很简单，就是为了诞育一个具有科尔沁血统的继承人。皇太极迎娶哲哲后，一直没有生下儿子，于是在后金天命十年（1625年）的时候，在哲哲怀孕期间，皇太极迎娶了哲哲的亲侄女孝庄为侧福晋，实际上，这个时候孝庄只是哲哲的替补而已。
